De endoscopische behandeling van Barrett slokdarm omvat meerdere technieken dia via endoscopisch onderzoek uitgevoerd kunnen worden. Hiervan zijn endoscopische resectie (verwijderen) en radiofrequente ablatie (wegbranden) de meest toegepaste technieken. De keuze voor het type behandeling is van meerdere factoren afhankelijk en zal met de patiënt op de polikliniek worden besproken. Deze behandelingen kunnen in de meeste gevallen uitgevoerd worden met een roesje, welke bestaat uit een slaapmiddel en een pijnstiller.